А что толку связываться с омичами? Они, на сколько мне известно, действуют на общественных началах, без поддержки администрации...

пожертвования+администрация - я согласна!

в Питере, например, торгует фирма "Кронвет" чипами, сканерами и специальной программой для занесения в базу данных на диске). Чипы стоят около 400 руб, сканер около 13 тыс.руб, программа около 5 тыс.руб. Как они сами говорят, каждый чип нужно проверять, процентов 5% не читается, т.е. перед тем, как имплантировать чип, его нужно считать сканером. Чипы вроде Байеровские ул. Костюшко, д. 17а, (812) 346-50-03, kronvet@mail.ru

Если ввести обязательную регистрацию, но животное не стерилизовано, люди могут выбросить потомство?

Есть такая штука - поиск по Гуглу...

Могут, конечно. Поставить эти вопросы под абсолютный контроль не получится ни в каком случае - ну, кроме оруэлловского варианта, разве что.
Но.
Давайте подумаем, кто и почему выбрасывает детенышей.
А это определенно:
1) Люди, не уследившие за кошкой/сукой, которым не удалось пристроить детенышей - но жаль и умертвить помет;
2) Люди, которым вообще не приходит в голову предотвращать беременность питомицы;
3) И последнее по порядку, но не по значению - коробочники и перекупщики, к которым детеныши попадают от первых двух категорий.

На коробочников можно и нужно давить административно: ну там, нарушение правил торговли, отсутствие ветеринарных документов на животных, нарушение санитарных норм и правил, итд.
А вот первые две категории могут поступать таким образом вовсе не потому, что им плевать на выброшенный выводок (было бы плевать - утопили бы новорожденными) - а потому, что они:
а) не знают, как можно предотвращать беременность животного; не понимают, зачем оно вообще нужно; и считают это весьма хлопотным/затратным делом;
б) рассчитывали пристроить потомство - но не сумели;
в) обольщаются тем, что о выброшенных котятах/щенках кто-то обязательно позаботится - или же что те сумеют выжить и сами, потому что "это же животные, им на свободе даже лучше".

Так вот, категории б) помог бы приют + направление на льготную стерилизацию, во избежание повторения ситуации (общество защиты животных или муниципальное предприятие могли бы иметь договоренность с ветклиникой на скидки для какого-то количества клиентов - для самой же ветклиники это могло бы быть рекламой; как вариант, часть льготных стерилизаций могла бы оплачиваться городом - ну, опять-таки, если удастся убедить горадминистрацию).
А вот категории а) и в) нужна элементарная информация; ну и, опять-таки, если нужно и есть такая возможность - направление на льготную стерилизацию. И то, и другое они могут получить во время регистрации (харьковчане, как Вы уже успели узнать, предоставляют при регистрации пакет информационных материалов на тему ответственного обращения с животными). Тогда же и там же можно предложить прочипировать животное, и объяснить преимущества этого метода идентификации.

Таким образом, обязательная регистрация действительно поможет снизить количество невостребованных котят/щенков - а значит, и количество выброшенных детенышей.